org.simBio
Class ResultGenerator

java.lang.Object
  org.simBio.Run
      org.simBio.ResultGenerator

public class ResultGenerator
extends Run

Apply different protocols to a model, and change the parameters such as magnitude of the currents. Arguments: [an xml file of model] [an xml file of protocol].
シミュレーション結果を多数生成するdmパッケージentry。 最初の引数に基準のmodel xmlを、2番目の引数にパラメータ生成プロトコルを記述したxmlを指定して下さい。

例として、xml/matsuoka_et_al_2003/APDにINaICaLContourPlot.png作成に用いたxmlがあります。 model.xmlがAPDを計測する為の基準model xmlで、 INaICaL.xmlがINa,ICaLのamplitudeを変化させるprotocol xmlです。 その結果生成されるcsvを整形した物がINa_ICaL.csvです。 INaICaLContourPlot.pngはjfreechartのContourPlotDemo.javaを利用して生成しました。

Version:

$Id: ResultGenerator.java,v 1.14 2007/11/08 07:17:29 mikaelwing Exp $

Author:

Shohei Hido

See Also:

"xml/matsuoka_et_al_2003/APD/model.xml", "xml/matsuoka_et_al_2003/APD/INaICaL.xml"

Field Summary

static boolean

cutDuration

Constructor Summary

ResultGenerator()

Method Summary

static void	demo(java.io.InputStream modelInput, java.io.InputStream protocolInput) Make protocols of parameter exchanging by running thrue all iterations.
static void	main(java.lang.String[] args)

Methods inherited from class org.simBio.Run

setMaxThreads, start

Methods inherited from class java.lang.Object

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

Field Detail

cutDuration

public static boolean cutDuration

Constructor Detail

ResultGenerator

public ResultGenerator()

Method Detail

main

public static void main(java.lang.String[] args)

See Also:

Run.main(java.lang.String[])

demo

public static void demo(java.io.InputStream modelInput,
                        java.io.InputStream protocolInput)

Make protocols of parameter exchanging by running thrue all iterations.

Parameters:

modelInput -

protocolInput -